A Folha de São Paulo, publicou no Caderno Ciência (19/04/2010), uma reportagem alertando sobre os desmatamentos legais produzidos pelo PAC.
Conforme consta na reportagem, a derrubada legal de projetos do programa chega a 730 km2 e inclui áreas de preservação permanente em vários biomas, o que equivale uma área da metade do Estado de São Paulo. "O montante desmatado nesses três anos inclui extensões na região amazônica, mas também no cerrado e na caatinga, inclusive em áreas de preservação permanente, como margens de rios e topos de morros."